值得注意的是第二种情况。也就是首套房是以贷款的方式购买，在出售后再购新房进行贷款时，在选择商业贷款与公积金贷款时，结果就会截然不同。由于商业贷款现时实行的是“既认房又认贷”的判断方式，只要银行保留着这套房产的贷款记录，即使首套房已经卖掉，再新购的住房也只能算是二套房处理，进入了限购的规则当中，首付比例为六成，贷款利率上浮10%。
但这对于公积金贷款而言，则大不相同。目前在公积金贷款的首套房认定上，并非是“认房又认贷”，而只是“认房”。也就是说，即使是首套住房以贷款的方式购买，但只要已经出售，再购的新房也算“首套”，首付比例仍然为三成，而贷款利率仍是基准利率。
以100万元总价的住房来计算，在首套贷款购买的住房已出售的情况下，第二次贷款购房，使用公积金贷款的首付为30万元，可贷款70万元，而商业贷款首付为60万元，可贷款40万元。这对于改善型置业家庭而言，在首付成本上，公积金贷款有着明显的优势。
优势三：
公积金贷款操作相对容易
银行信贷额度不足在现时已经是“公开的秘密”，在一二季度甚至有过部分银行限制放贷的传闻。从各大银行纷纷调高首套房首付比例的情况可以看出，现时购房者想从银行贷到钱买房已经并不容易。
这种情况直至现在也仍然存在。番禺某新盘负责人告诉记者，现时该盘的代理银行已经拒绝接受商业+公积金的组合贷款，而更多的客户选择合额公积金的贷款模式。“现在贷款的申请跟2009年以前的情况完全相反。”该负责人向记者介绍，在以前，商业贷款虽然利率高一点，但在放贷速度要比公积金贷款要快很多。但现在由于银行审批非常严，流程走得很慢，有时候公积金比商业贷款的审批还要快。“之前商贷对于客户提供的资料要求并不是非常严格，甚至律师费、保险费银行都可以减免，但现在则抓得很严，手续也变得非常麻烦，收取费用也卡得很紧。相比之下，公积金就显得容易操作得多。”
